Examinando por Materia "PCR"

Mostrando 1 - 2 de 2

Aislamiento e identificación molecular de hongos en bananos con y sin manchas foliares
(Universidad de Costa Rica, 2026-04-08) Mogollón Farias, César Augusto; Cordova Campos, Jose Stalyn; Garcia Garcia, Segundo Melecio; Ruiz Polo, Archi Alejandro; Mialhe, Eric
Introducción. La estructura foliar del banano es un factor determinante en el rendimiento y desarrollo del cultivo. La composición microbiana en manchas foliares es relevante para entender la aparición y propagación de enfermedades. Objetivo. Realizar el aislamiento e identificación molecular de hongos en bananos con y sin manchas foliares. Materiales y métodos. En el año 2019 se realizó una investigación con diseño no experimental, enfoque cuantitativo y nivel descriptivo, utilizando hojas de banano de Musa acuminata (cv. IC2) con manchas (HCM) y sin manchas (HSM), recolectadas en una parcela agrícola con manejo convencional situada en el norte del Perú. En medios de cultivo microbiológicos se cultivaron fragmentos de hojas de 5 x 5 mm, se aislaron cepas fúngicas caracterizándose por sus macroestructuras, se extrajo ADN de las cepas y se realizó una PCR convencional dirigida a la región ITS de hongos de 700 pb. Luego, los productos PCR se secuenciaron por el método de Sanger en doble cadena. Posteriormente, se realizaron las asignaciones taxonómicas a nivel de especie utilizando la herramienta BLAST, basada en la comparación por homología con secuencias del GenBank. Resultados. Se identificaron un total de once especies fúngicas en HCM y ocho en HSM, abarcando tanto especies fitopatógenas como no fitopatógenas. Las especies predominantes en el HCM fueron Fusarium spp., Cladosporium cladosporioides y Lasiodiplodia theobromae. Además, se observó que HCM compartía tres géneros con HSM: Nigrospora, Cladosporium y Fusarium. Conclusión. Se realizó el aislamiento e identificación molecular de hongos en bananos con y sin manchas foliares, hallándose especies fitopatógenas y benéficas.
The presence of tomato brown rugose fruit virus (ToBRV) in tomatoes from the southern peruvian coast
(MDPI, 2024-01-19) Rodriguez Grados, Pedro Manuel; Saldaña Serrano, Carla Lizet; Estrada Cañari, Richard; Salazar Coronel, Wilian; Contreras Liza, Sergio; Arbizu Berrocal, Carlos Irvin
Tomato (Solanum lycopersicum) (Solanaceae) is an important vegetable crop worldwide that contains significant amounts of vitamins A and C. It also possesses a powerful antioxidant, lycopene, which can help prevent the development of many forms of cancer. However, this vegetable is highly susceptible to a number of emerging viruses. Since the first report of ToBRFV in Jordan, this emerging virus has been detected in Germany, Israel, Italy, Mexico, Palestine, and the United States, but its incidence was not reported in Peru. We collected 56 samples of fresh leaves of tomato plants with viral symptoms and 13 without symptoms as control from two regions that comprise more than 50% of tomato production in Peru, Lima and Ica. Mosaic, mottling, plant stunting and brown rugose symptoms were observed in collected leaves that were preserved in liquid nitrogen until processing. We extracted RNA using a commercial Kit. For virus identification, we used the reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) technique for the amplification of the capside protein (cp) gene. Specific primers were designed using the NCBI tool by collecting all available cp sequences from Peru Tomato mosaic virus (PToMV) and Tomato Brown Rough Fruit Virus (ToBRV). Results were observed on 1.5 % agarose gels using Gelred(Biotium®, Fremont, CA, USA) and by standard spectrophotometry. We observed the presence of ToBRFV in 24 samples, PToMV in 8 samples and 11 samples presented a mixed infection with ToBRV and PToMV. To the best of our knowledge, this is the first report of ToBRFV in Peru.