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Carbon storage in coffee agroforestry systems: Role of native and introduced shade trees in the central Peruvian Amazon
(MDPI, 2025-06-30) Salgado Veramendi, Noelito; Romero Chavez, Lorena Estefani; Huerto Pajuelo, Eldhy Sianina; Ibarra Porra, Carolina del Carmen; Cunyas Camayo, Joseph Michael; Aldava Pardave, Uriel; Vallejos Torres, Geomar; Solórzano Acosta, Richard Andy
What is the potential impact on carbon storage of the native and introduced tree species commonly associated with coffee in the central Peruvian Amazon? Coffee is a pivotal crop within the Peruvian economy. Nevertheless, the establishment of new plantations—driven by the subsistence needs of smallholder farmers—has led to expansion into forested areas. Given the significance of this crop and the demonstrated ecosystem benefits of agroforestry systems (AFSs), the aim of this study was to evaluate the influence of native and introduced shade tree species on carbon storage in coffee plantations. This study was observational and exhibited characteristics of an unbalanced incomplete block design. Agroforestry systems (AFSs) with shade tree species such as Inga, Retrophyllum rospigliosii, Eucalyptus and Pinus, and three unshaded coffee plantations, were included in this study. The total carbon stored in each AFS was higher than in unshaded coffee plantations. Soil contributed between 47% and 91% to total carbon storage, shade trees (24–46%), coffee (2–7%), leaf litter (0.6–1.9%) and shrubs and herbaceous plants (0.02–0.3%). The AFS with R. rospigliosii achieved the highest carbon storage with 190.38 Mg ha−1, highlighting the compatibility of this species with coffee plantations, as well as its positive effect on climate change mitigation in deforested areas.
Seasonal and dietary effects on the hematobiochemical parameters of creole goats in the Peruvian Andes
(MDPI, 2025-07-23) Rodriguez Vargas, Anibal Raul; Sessarego Davila, Emmanuel Alexander; Castañeda Palomino, Katherine; Ormachea Sanchez, Huziel Héctor; Trillo Zarate, Fritz Carlos; Temoche Socola, Victor Alexander; Ruiz Chamorro, José Antonio; Cruz Luis, Juancarlos Alejandro
Creole goats have adapted to the harsh Andean environment, yet the physiological impacts of high-altitude production systems remain underexplored. This study assessed seasonal and dietary influences on the hematological and biochemical profiles of 45 Creole goats in the Peruvian Andes. The animals were assigned to three diets: D1 (grazing), D2 (grazing + 2000 g hay), and D3 (grazing + 400 g concentrate), across rainy and dry seasons. Biweekly blood sampling measured urea, cholesterol, total protein, albumin, ALP, ALT, WBCL, NeuP, LymP, HGB, and MCV. Season exerted the strongest influence (p < 0.001), with modest dietary effects and a consistent effect of sampling time. Urea, total protein, and albumin increased during the rainy season, though only urea responded significantly to diet. Leukocytosis rose in the dry season and with higher-protein diets, suggesting heightened immune activation under environmental stress. Hemoglobin peaked in the rainy season and early sampling, indicating better oxygenation. MCV and body weight were higher in the dry season, with weight unaffected by diet. These results underscore the complex interplay of environmental and nutritional factors in shaping goat physiology at high altitudes, emphasizing the importance of dynamic modeling in sustainable Andean livestock systems.
Integration of agronomic information, vegetation indices (VIs), and meteorological data for phenological monitoring and yield estimation of rice (Oryza sativa L.)
(Elsevier, 2025-07-15) Fernandez Jibaja, Jorge Antonio; Atalaya Marin, Nilton; Álvarez Robledo, Yeltsin Abel; Taboada Mitma, Víctor Hugo; Cruz Luis, Juancarlos Alejandro; Tineo Flores, Daniel; Goñas Goñas, Malluri; Gómez Fernández, Darwin
Rice (Oryza sativa L.) is a staple crop for sustaining global food security and is particularly important in tropical and subtropical regions. In this context, precision agriculture enables more efficient crop management to increase productivity and sustainability. This study proposes an integrated framework for monitoring the phenological development and estimating the yield of O. sativa by combining agronomic variables, vegetation indices (VIs), and meteorological data. Six rice varieties (Victoria, Esperanza, Bellavista, Puntilla, Capoteña, and Valor) were evaluated across six phenological stages using field data, 20 VIs and meteorological parameters. Field data revealed greater tillering of the Puntilla and Valor varieties (9–28 tillers), with Esperanza having the most stable chlorophyll values (21.5–38.7, σ = 10.46) during ripening. The temporal dynamics of the VIs consistently increased from the seedling to inflorescence emergence stage, followed by a decrease during flowering and ripening, which aligns with known physiological transitions in rice; however, significant differences in the NDVI index were detected during ripening (p > 0.05). For yield estimation, feature selection was performed using principal component analysis (PCA) and the least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) to increase model efficiency and interpretability. Among the regression algorithms tested, support vector regression (SVR) demonstrated the highest predictive accuracy (R² = 0.81) for the Bellavista variety at the maximum tillering stage. Furthermore, the Valor variety presented the highest grain yield (13.70 t/ha). These results underscore the potential of integrating multisource data with machine learning techniques for high-resolution phenological monitoring and varietal performance assessment.
SNP profiling of Elaeis oleifera (H.B.K) cortes germplasm in Ucayali, Peru using genotyping-by-sequencing (GBS)
(Springer Nature, 2025-07-17) Camacho Villalobos, Alina Alexandra; Mestanza, Orson; Cabrera Pintado, Rosa María; Sanchez Sunción, Glendy; Bendezu, Jorge
Objectives Elaeis oleifera, commonly known as the American oil palm, plays a crucial role in the agricultural economies of Central and South America due to its unique oil characteristics and resistance to certain diseases. Despite its importance, limited available genetic information has hindered the effective utilization of this species in breeding programs aimed at improving oil yield and disease resistance. This study employed Genotyping-bySequencing (GBS) to profile polymorphisms within Elaeis oleifera populations, the unique germplasm bank for Peru, located in Ucayali, Peru, aiming to characterize the gene pool.
Data description The GBS analysis successfully identified 22,703 informative single-nucleotide polymorphisms (SNPs) across the twelve-year-old plant genomes (n=42). Observed heterozygosity (Ho=0.3086) and expected heterozygosity index (He=0.3385) were quantified. The fixation index (Fst=0.0048) indicated low genetic differentiation within the germplasm. However, the presence of two genetic clusters (C_1 and C_2) distributed homogenously within the studied population has been detected; the origin of these clusters could be mainly associated with the initial management of the germplasm nucleus within Peru. The extensive SNP dataset provides a comprehensive genetic map that is invaluable for the conservation and enhancement of Elaeis oleifera in our region.
Acta de conformación de los integrantes de la Comisión Técnica Regional de Innovación Agraria. Región Junín
(Instituto Nacional de Innovación Agraria, INIA, 2025-06-17) Instituto Nacional de Innovación Agraria, INIA
El Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA), a través de la Estación Experimental Agraria Santa Ana, convocó a representantes de las Instituciones Públicas Especializadas y Programas del Ministerio de Desarrollo Agrario y Riego, así como a las Direcciones Sectoriales Regionales del Gobierno Regional de Junín; así como representantes de los Gobiernos Locales —incluidas las municipalidades provinciales de Junín, organizaciones de productores, empresas del sector agrario, organizaciones no gubernamentales (ONG), entre otros actores relevantes. Con el objetivo de fortalecer la innovación agraria regional a través de un trabajo articulado entre los diversos participantes, y dinamizar la coordinación y operatividad del Sistema Nacional de Innovación Agraria (SNIA) en la región Junín, se acordó la renovación de la Junta Directiva de la Comisión Técnica Regional de Innovación Agraria (CTRIA). Esta comisión está conformada por instituciones públicas y privadas vinculadas al desarrollo del sector agrario. Durante la jornada, se presentó la ponencia “Alcances del Decreto Legislativo N.º 1060 y el rol del INIA como ente rector del SNIA”, tras lo cual se llevó a cabo un proceso democrático para la elección de los nuevos integrantes de la comisión. La nueva Junta Directiva quedó integrada por cuatro miembros del cuerpo directivo y doce del cuerpo técnico, con representación tanto del sector público como del privado.
Acta de conformación de los integrantes de la Comisión Técnica Regional de Innovación Agraria. Región Huancavelica
(Instituto Nacional de Innovación Agraria, INIA, 2025-04-16) Instituto Nacional de Innovación Agraria, INIA
El Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA), a través de la Estación Experimental Agraria Santa Ana, convocó a representantes de las Instituciones Públicas Especializadas y Programas del Ministerio de Desarrollo Agrario y Riego, así como a las Direcciones Sectoriales Regionales del Gobierno Regional de Huancavelica. También participaron representantes de los Gobiernos Locales —incluidas las municipalidades provinciales de Huancavelica, Churcampa y Angaraes, organizaciones de productores, empresas del sector agrario, la Universidad Nacional de Huancavelica, organizaciones no gubernamentales (ONGs), entre otros actores relevantes. Con el objetivo de fortalecer la innovación agraria regional a través de un trabajo articulado entre los diversos participantes, y dinamizar la coordinación y operatividad del Sistema Nacional de Innovación Agraria (SNIA) en la región Huancavelica, se acordó la renovación de la Junta Directiva de la Comisión Técnica Regional de Innovación Agraria (CTRIA). Esta comisión está conformada por instituciones públicas y privadas vinculadas al desarrollo del sector agrario. Durante la jornada, se presentó la ponencia “Alcances del Decreto Legislativo N.º 1060 y el rol del INIA como ente rector del SNIA”, tras lo cual se llevó a cabo un proceso democrático para la elección de los nuevos integrantes de la comisión. La nueva Junta Directiva quedó integrada por seis miembros del cuerpo directivo y once del cuerpo técnico, con representación tanto del sector público como del privado.
Diversidad de hongos formadores de micorriza arbuscular en plantas cultivadas de Swietenia macrophylla en la Amazonía peruana
(Fundación Miguel Lillo, 2025-07-03) Herrera, Isabel; Rojas, Krystel; Gárate, Merlin H.; Guerra, Héctor; Revilla, Jorge M.; Flores Bendezú, Ymber; Sieverding, Ewald
Los hongos micorrizógenos arbusculares (HMA) constituyen un potencial microbiano, para su uso sostenible en la agroforestería y restauración ecológica. Actualmente en Perú la contribución de diversidad HMA es limitada y no existen reportes de la diversidad nativa de HMA asociados a plantas cultivadas de caoba (Swietenia macrophylla G. King), una especie forestal vulnerable, de interés en programas de reforestación y restauración ecológica. El objetivo de este estudio fue identificar la diversidad de morfoespecies de HMA en plantas cultivadas de S. macrophylla G. King, así como el número de esporas y porcentaje de colonización de HMA en cinco zonas de muestreo ubicadas en los departamentos de Ucayali, San Martín y Huánuco. Se emplearon quince individuos de S. macrophylla G. King por cada zona de muestreo. Se identificaron 35 morfoespecies de HMA en el área de estudio, encontrando mayor riqueza de morfoespecies en los distritos de Chazuta y Von Humbolth departamento de San Martin y Ucayali respectivamente. Las especies de HMA predominantes fueron las de las familias Acaulosporaceae y Glomeraceae con 13 en cada familia. Ambispora reticulata se encontró en común para cuatro zonas de muestreo; mientras que 19 morfoespecies se encontraron exclusivas de una zona de muestreo. El estudio reveló mayor número de esporas en las zonas de muestreo con plantas de menos de un año de establecimiento. El porcentaje de colonización no varió significativamente entre los sitios, donde se encontraron en promedio 42% de colonización por HMA en raíces en todas las zonas de muestreo.
Índice de sitio para plantaciones forestales de Handroanthus spp. en la región Ucayali, Perú
(Herbario “Alwyn Gentry” (HAG), Universidad Nacional Amazónica de Madre de Dios, 2025-01-30) Flores Bendezú, Ymber
Este estudio desarrolló por primera vez un modelo de índice de sitio para Handroanthus serratifolius ("tahuarí amarillo") en la región de Ucayali, Perú, con el fin de evaluar su productividad en plantaciones forestales. Se utilizaron datos de altura dominante y edad de 123 árboles distribuidos en 11 sitios experimentales. Se aplicaron los modelos de Schumacher (exponencial) y Chapman-Richards (sigmoidal), ambos ampliamente empleados en modelación forestal. La edad base se fijó en 15 años. Los modelos fueron ajustados mediante regresión no lineal y evaluados usando indicadores estadísticos como R², RMSE, AIC y BIC. El modelo de Chapman-Richards mostró un mejor desempeño predictivo (R² = 0.83; RMSE = 1.77 m), capturando de forma más realista el crecimiento sigmoidal de la especie. Se generaron curvas anamórficas de índice de sitio, útiles para comparar la calidad del sitio entre plantaciones. Los resultados aportan herramientas clave para la planificación forestal sostenible de H. serratifolius y permiten su aplicación en programas de manejo, restauración y aprovechamiento forestal en la Amazonia peruana.
Línea Mantaro
(Instituto Nacional de Innovación Agraria – INIA, 2025-07-14) Kajakk Castañeda, Nancy; Párraga Dávila, Nicolas Fernando; Mulato Sánchez, Joe; Reyes Quinto, Rosario del Pilar
La Estación Experimental Agraria Santa Ana de la Región Junín, mediante el programa de mejoramiento genético por selección del cuy Tipo 1 (Mantaro), inició en 1997 (basada en selección por peso) con fin de producción de carne. El estudio de línea de base empezó con 144 cuyes recolectadas de las principales granjas de la localidad de San Martín, generaciones procedentes de comunidades latinas del valle del Mantaro y ecotipos de Arequipa. Se determinó registrar los siguientes parámetros: el peso de las crías al nacimiento, al destete y a las 4 semanas de edad, 8 semanas de edad (pubertad) para evaluar su capacidad de respuesta (incremento de peso) y 13 semanas de edad. En el proceso de adaptación e incremento poblacional se evaluaron 1 338 registros de progenie (Línea Base Control), de un total de 25 machos y 183 reproductoras con una relación de empadre promedio 1:7. Entre el 1998 y el 2016 fueron evaluados 12 495 registros de progenie para ser seleccionados por su precocidad. A partir del 2017 al 2020 se consolida la línea evaluando 1887 cuyes. La Línea MANTARO se caracteriza por tener el pelo liso y corto, con roseta corona en cabeza, color de manto “colorado” en mayor proporción del cuerpo moteado con blanco en cabeza, color de ojos negros, numero de dedos con 4433 dedos. El empadre se realiza sobre las 10 semanas con un peso promedio de 975 g, se manejan en una relación de empadre de 1:7, el intervalo entre partos (días) es de 86 ± 3.8, su tamaño de camada 2.64 ± 0.04. El 83.40%, tienen partos múltiples con 2 a más crías. El peso al nacimiento en machos es de 151.8±1.1 g, al destete 292.4, a las 4 semanas 401.2 y a la edad de 8 semanas es de 629.1±4.8 g y a las 13 semanas 828.8±5.2. La línea Mantaro permite una inversión con una probabilidad del 97.89% en obtener rendimientos superiores a los 0.801 Kg /cuy, además la adopción de la tecnología tiene un riesgo económico de un 0.0%. la línea Mantaro presenta una mayor rentabilidad comparada con las bases genéticas nativas.
Optimized In vitro propagation and somatic embryogenesis of camu camu (Myrciaria dubia) cultivar Vitahuayo for enhanced commercial production
(Agricultural Research Communication Centre (ARCC Journals), 2025-03-12) Adrianzén, Pedro M.; Pinedo Freyre, Sergio Fernando; Valles, Barbara S.; Marapara, Jorge L.; Cobos, Marianela; Rodríguez, Hicler N.; Castro, Juan C.
Background: Myrciaria dubia “camu-camu” a fruit-bearing shrub native to the Amazon, is known for its high vitamin C content. However, variations in vitamin C biosynthesis and accumulation among different cultivars present challenges for commercial production. This study aimed to establish an efficient in vitro regeneration protocol for the Vitahuayo cultivar through callus induction and somatic embryogenesis.
Methods: Stem and leaf explants were cultured on Murashige and Skoog (MS) medium supplemented with 24-dichlorophenoxyacetic acid (24-D) and 6-benzylaminopurine (BAP) to induce callus formation. Somatic embryos were induced using Woody Plant Medium (WPM) supplemented with 2,4-D, thidiazuron (TDZ), indole-3-butyric acid (IBA), naphthaleneacetic acid (NAA) and kinetin (KIN).
Result: The best results for callogenesis were obtained with 1 mg/L of 24-D and 0.5 mg/L BAP. Somatic embryos were successfully induced with treatments T2 (2,4-D at 3 mg/L, NAA at 20 mg/L and KIN at 15 mg/L) showing 90% efficiency, while T3 (KIN at 0.3 mg/L and BAP at 0.05 mg/L) achieved 57.5% effectiveness. These findings offer great potential for the large-scale propagation of Vitahuayo, the optimization of its commercial production and the standardization of vitamin C biosynthesis.